Multi-ChromatoAnalysT Ver.2を公開しました

2026-08-082026-08-23

Ver.1.6.1で追加したOffset表示、1クロマトグラム内の複数ピーク選択、XIC解析を土台に、Ver.2.0.1.3ではデータ読み込みから定量、Report、統計解析までの流れを大幅に整理しています。

今回の更新では、対応データを増やすだけではなく、ピーク範囲と面積の整合性、検量線の確認、解析前チェック、結果の再利用といった、日常の定量作業で迷いやすい部分を重点的に改善しました。

Open Dataを一本化

File > Open Dataから、ファイルとデータフォルダを同じ画面で選択できるようになりました。選択した対象がファイルかフォルダかを自動判定し、対応する方法で読み込みます。

ファイルとデータフォルダの複数選択に対応
ドラッグ＆ドロップとOpen Dataで同じ読み込み処理を使用
設定した並列数の範囲で複数データを読み込み
MRM / SRM、scan XIC、TIC、テキストクロマトグラムをデータ内容に応じて処理
読み込み開始・完了、対応外形式、重複などの理由を画面上で案内

プロジェクトファイルの読み込み方法も変更しました。すでに開いているSampleを消去せず、読み込んだプロジェクトのSampleを追加します。同じSample名がある場合だけ警告し、確認後に該当Sampleを置き換えます。

同じ拡張子でも、測定モードや付随ファイルの有無によって内容が異なります。初めて扱うデータでは、既知試料を用いてクロマトグラム数、RT、TIC / XIC形状を確認してください。

XIC sheetを使ったscan解析を強化

ScanデータからXICを作成するためのCSV設定を拡張しました。MS1 / MS2、Polarity、precursor、product ion、ppm、RT範囲を設定し、測定データから目的のクロマトグラムを抽出できます。

MS1とMS2を行ごとに指定
正・負のPolarityを考慮
ppm値をtarget m/zの両側へ均等に適用
分子式とPrecursor ionからExact mass、m/z、PolarityをFill
SMILESが入力されている行はStructureで構造式をPopup表示し、画像をCopy可能

FillはCSVを自動保存しません。計算結果を確認してから、画面上部のSaveで保存してください。

クロマトグラム表示とピーク定量を改善

表示Styleは、Dark、White、Smooth black、Smooth whiteの4種類になりました。Smooth StyleではRaw lineを残したまま、SmoothingとSaturation補正後のlineを重ねて比較できます。

クロマトグラムのSmoothing強度とRaw lineの透過率をSettingで調整
設定値以上で平らになったSaturation部分を推定曲線で補正
処理後のchromatogramを表示だけに使うか、Area / Heightの定量にも使うかを選択
Range buttonでX / Yの表示範囲をchart上から指定
LOCKをONにすると、左クリック・左ドラッグによるpeak range変更だけを一時的に無効化
画面が小さい場合は操作欄をスクロールして下部の機能を表示

複数ピークを指定した場合は、最前面のクロマトグラムへ1、2、3のような番号を表示します。面積は指定範囲内でchromatogramがbaselineより上にある部分を計算し、baselineより下の部分は0として扱うため、負のAreaを生じにくい方式に統一しました。

Intensity threshold、baseline、Alignmentの判定は、重ね描きした各クロマトグラムごとに行います。表示、面積計算、Judgement、Import / Exportで同じΔRTを使用するよう整理しています。

Saturation補正は、失われた実測値を復元するものではなく推定値です。定量へ使用する場合は、未飽和の希釈系列や既知濃度試料を使って、補正前後の直線性と再現性を確認してください。

Sample GroupとJudgementを見やすく

SampleはG1からG9へグループ分けでき、Settingでグループ数と色を変更できます。外部検量線へ使用するSampleはGroupをCCにすると、Conc.の入力が有効になります。

G1～G9の色をPCA、OPLS-DA、Volcano、Dendrogramへ反映
Red、Yellow、Green、Gray、Whiteでpeak状態を表示
apexがrangeの左端または右端にある場合をRedで警告
低いS/N相当の状態やrange端への接触をYellowで注意表示
threshold以下または有効signalがない場合をGrayで表示

Judgementは自動採否を決めるものではありません。RedやYellowが表示された場合は、range、baseline、ΔRT、noise、Intensity thresholdを確認してください。

Report Sheetと検量線を更新

従来のReport spread sheetはReport Sheetへ名称を変更し、上部の機能を整理しました。AreaまたはHeightを選び、Summary、Calibration、Curve、Stats、Saveへ進めます。

検量線の重み付け

検量線の回帰には、None、1/x、1/x²の3種類を追加しました。従来のw=10ⁿによる値のscalingも、別機能として残しています。

None：すべてのpointを同じ重みで回帰
1/x：低濃度側へ大きい重みを設定
1/x²：1/xより低濃度側を強く重視

検量線pointの比較とApply

Curve画面では元の検量線を残したまま、任意pointのUsed / Excludedをクリックで切り替え、調整中の検量線を重ねて確認できます。元curveの式とR²は左上、新しいcurveの式とR²は右上に表示します。

pointの値そのものは削除しません。Applyを押したときだけ、調整後のUsed / Excluded状態をCalibrationへ反映します。空欄cellは除外し、使用可能なpointでR²を再計算します。

R²だけを上げるための恣意的なpoint除外は避け、blank、carryover、saturation、peak形状、調製誤差など、分析上の根拠を記録してください。

統計解析をPrecheckから開始

Statsを押した直後にすべての解析を実行せず、最初にPrecheck / Box plotを表示する方式へ変更しました。解析対象のCompoundを選んでから各tabへ移ることで、不要な計算と待ち時間を減らします。

Group別Sample数とSample不足の警告
Group未設定の確認
Missing value、zero variance、extreme outlierの確認
Sample数に対して変数が多すぎる場合の警告
Use checkbox、Check all、Clear allによるCompound選択

選択後は、PCA、OPLS-DA、Volcano plot、Box plot、Dendrogram / Heatmapを各tabで表示できます。PCA以外の解析もApply to Reportに対応し、解析条件と数値結果をReport workbookの専用sheetへ保存できます。

PCA：PC1 / PC2、Scores、Loadings、寄与率
OPLS-DA：predictive / orthogonal score、Fitted Y、R2X、R2Y
Volcano plot：group mean、log2 fold change、p-value、Up / Down / Other
Box plot：N、Minimum、Q1、Median、Q3、Maximum
Dendrogram / Heatmap：Sample tree、Compound tree、leaf順、group色、merge distance

統計結果は、前処理、欠損値処理、Group、Sample数、Compound選択によって変化します。Plotだけで判断せず、Precheckの警告と元の定量値を合わせて確認してください。

Meta Pickで確認済み条件を再利用

Meta Pickは、保存済みmetadataに記録されたpeak rangeと定量条件を、同じCompound名を持つchromatogramへ再適用する機能です。AI modelが新しいpeak位置を推定するAI Pickとは目的が異なり、Meta Pick実行時にAI学習やPython処理は行いません。